Освоение Екатерининской гавани началось в 1723 г., когда Пётр I подписал указ об организации Кольского китоловного промысла. С 1803 г. была основной базой Беломорской китобойной компании.
В 1896 г. началось осушение местности и в 1899 г. был официально открыты новый административный центр края - город Александровск-на-Мурмане и порт. Назван в честь жены Николая II императрицы Александры Фёдоровны (1872-1918 гг.). Позже стал называться Александровск.
Вид на город Полярный с моря
В 1898-1929 гг. здесь базировалась биологическая станция, переведённая с Соловецких островов.
В 1900 г. из Александровска на поиски т.н. Земли Санникова отправилась экспедиция Э.В. Толля на судне "Заря", в 1912 г. отсюда уходили полярные экспедиции Г.Л. Брусилова на шхуне "Св. Анна" и В.А. Русанова на судне "Геркулес". С 1935 г. главная база Северного флота.
В 1930 г. переименован в Полярный. Город Полярный с 1939 г.
В годы Великой Отечественной Войны через Полярный осуществлялось движение союзных конвоев (всего их проведено 1548).
В современном городе Полярном действуют предприятия по обслуживанию рыбной промышленности.