Населённый пункт на месте современного Кишинёва упоминается в 1466 году в жалованной грамоте молдавского господаря Штефана Великого своему дяде, боярину Влайкулу, на право владения селищем Кишинёв у колодца Албишоара. Более 100 лет потомки Влайкула владели этими местами.
В условиях османского ига, установившегося в Молдавии в середине XVI века, постоянных набегов турок и крымских татар, роста поборов экономическое развитие города шло замедленными темпами, а страна в XVII - начале XVIII веков переживала упадок. Вначале боярская вотчина, а затем с 1641 года - вотчина монастырей румынского города Яссы, Кишинёв неоднократно разрушался.
В результате серии русско-турецких войн территория междуречий Днестра, Прута и Дуная в 1812 году отходит к России, получает название Бессарабия. Кишинёв, принадлежавший в то время монастырю св. Гроба, получает официальный статус города в 1818 году (первый примар - городской голова - Ангел Ноур) и становится центром Бессарабской области, а с 1873 года - центром Бессарабской губернии.
В 1834 год правительством был утверждён генеральный план развития Кишинёва, по которому город развивался до 1949 года. Был определён центр города, его главная площадь, центральный парк (ныне Сквер Кафедрального собора). Прямоугольная и чёткая сетка широких улиц соответствовала градостроительной практике застройки южных городов России. В старом городе предпринимались попытки спланировать улицы и кварталы: некоторые дома сносились, улицы выравнивались.
Кафедральный собор
В 1830-х годах Кишинёв - центр Бессарабской Епархии - становится местом строительства кафедрального Собора. В 1833 году построена немецкая лютеранская церковь св. Николая. Сейчас на её месте - Президентский дворец. В 1855 году открыт Ильинский базар, где можно было торговать продуктами. Базар существовал до 1960 года. Сейчас здесь находятся корпуса Экономической Академии и гостиница «Заря». 1856 год - на деньги купца Феодора Чуфли строится церковь св. Феодора Тирона.
В 1870 году был построен железнодорожный вокзал, а в 1871 было открыто сообщение по Тираспольско-Кишиневскому участку железной дороги. Уникальное трехэтажное здание вокзала, поражавшее современников законченностью форм и изяществом было полностью разрушено во время Второй мировой войны.
1880 год - открыт первый в Бессарабии музей. Назывался он «Музей Понта Скифского». Ныне не существует.
4 октября 1881 года, в Кишинёве, на углу улиц Измаильской и Киевской, «для приготовления следующих ремесленников-практиков» было открыто Александровское ремесленное училище.
6-7 апреля 1903 года - погром, в результате которого убиты 47 евреев, множество ранено, 700 домов сожжено и разграблено. 19-20 октября 1905 года - антицарские выступления обернулись вторым погромом, в ходе которого погибло 19 евреев.
В 1913 году строится Хоральная Синагога «Талмуд Тора» - монументальное здание с жестяным покрытием, общей площадью 1350 квадратных метров, с богатыми декором фасадами, арками и карнизами. Ныне в этом здании располагается Русский драматический театр им. А. П. Чехова.В начале XX века было создано несколько металлообрабатывающих предприятий (заводы Сербова, Ланге и Мокану и др.).
В 1918 Кишенев вошел в состав Румынии. С 1940 стал столицей Молдавии. В 60-80-е гг. созданы новые промышленные и жилые районы.
В городе развивается машиностроение (сельскохозяйственные машины, торговое и пищевое оборудование, холодильники, электроизмерительные приборы, телевизоры), пищевкусовая (винодельческая, плодоовощеконсервная, табачная), легкая (кожевенно-обувная, трикотажная), химическая, деревообрабатывающая (мебельная) промышленность.